蛋白質(zhì)電泳是一種用于分離、分析和鑒定蛋白質(zhì)混合物的常用實驗技術(shù)。其核心原理是利用電場力驅(qū)動帶電蛋白質(zhì)在凝膠介質(zhì)中遷移，根據(jù)蛋白質(zhì)的電荷、大小和形狀等特性的差異實現(xiàn)分離。

以下是詳細(xì)的工作原理和關(guān)鍵組成部分：

一、蛋白質(zhì)電泳核心基本原理

1、電荷性質(zhì)：

（1）蛋白質(zhì)是由氨基酸組成的生物大分子，其表面帶有正電荷（堿性氨基酸，如賴氨酸、精氨酸）或負(fù)電荷（酸性氨基酸，如天冬氨酸、谷氨酸）。

（2）在特定pH值的緩沖液中，蛋白質(zhì)會帶上凈電荷（正電荷或負(fù)電荷）。當(dāng)置于電場中時，帶正電的蛋白質(zhì)會向負(fù)極（陰極）遷移，帶負(fù)電的蛋白質(zhì)會向正極（陽極）遷移。

2、遷移率：

（1）蛋白質(zhì)在電場中的遷移速度（遷移率）取決于幾個關(guān)鍵因素：

（2）電荷/質(zhì)量比：凈電荷越大，受到的電場力越強(qiáng)；分子量越小，遷移阻力越小。因此，電荷/質(zhì)量比 是決定遷移速度的主要內(nèi)在因素。

（3）電場強(qiáng)度：電壓越高，遷移越快。

（4）凝膠基質(zhì)：凝膠（如聚丙烯酰胺凝膠）具有網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)，起到“分子篩"的作用。小分子蛋白容易通過孔隙，遷移快；大分子蛋白受阻大，遷移慢。這是常用于按大小分離蛋白質(zhì)的關(guān)鍵。

二、常用的方法：SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳（SDS-PAGE）

這是應(yīng)用廣泛、主要用于按分子量大小分離蛋白質(zhì)的方法。它通過一系列處理，消除了蛋白質(zhì)天然電荷和形狀的差異。

1、樣品處理：

（1）SDS（十二烷基）：一種陰離子去污劑，能破壞蛋白質(zhì)的非共價鍵（氫鍵、疏水作用），使其變性展開為線性結(jié)構(gòu)。

（2）還原劑（如β-巰基乙醇或DTT）：能打斷二硫鍵，使蛋白質(zhì)亞基解離。

（3）處理后，SDS以恒定的比例（約1.4g SDS / 1g 蛋白質(zhì)）非共價結(jié)合到蛋白質(zhì)肽鏈上，使所有蛋白質(zhì)都帶上大量均勻的負(fù)電荷（遠(yuǎn)超其原有的凈電荷差異）。

2、分離機(jī)制：

（1）在SDS-PAGE中，所有蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物都帶有與分子量成比例的負(fù)電荷（電荷/質(zhì)量比近似恒定），因此它們在電場中的遷移幾乎只取決于分子量的大小。

（2）蛋白質(zhì)在具有特定孔徑的聚丙烯酰胺凝膠中遷移時，小分子蛋白跑得快，大分子蛋白跑得慢，從而實現(xiàn)按分子量從大到小的梯度分離。

（3）通過與已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白（蛋白Marker）對比，可以估算未知蛋白的分子量。

3、凝膠系統(tǒng)：

（1）濃縮膠：位于凝膠頂部，孔徑較大，pH值不同。其作用是濃縮樣品蛋白，使其在進(jìn)入分離膠前形成一條狹窄的起始線，提高分辨率。

（2）分離膠：位于凝膠下部，孔徑較小，是按分子量進(jìn)行實際分離的區(qū)域。通過調(diào)整聚丙烯酰胺的濃度（如8%，12%，15%），可以控制孔徑大小，優(yōu)化不同分子量范圍的分離效果。

三、其他重要類型的蛋白質(zhì)電泳

1、非變性（天然）PAGE：

（1）在不添加SDS和還原劑的條件下進(jìn)行。

（2）蛋白質(zhì)保持其天然構(gòu)象、電荷和生物活性。

（3）遷移率同時取決于蛋白質(zhì)的凈電荷、大小和形狀。適用于研究蛋白質(zhì)復(fù)合物、酶活性等。

2、等電聚焦電泳：

（1）在具有連續(xù)pH梯度的凝膠中進(jìn)行。

（2）蛋白質(zhì)在電場中遷移，當(dāng)?shù)竭_(dá)其等電點（pI，即蛋白質(zhì)凈電荷為零的pH值）的位置時，停止遷移。

（3）主要用于根據(jù)蛋白質(zhì)的等電點（pI） 進(jìn)行高分辨率分離和測定。

3、二維電泳：

（1）結(jié)合了等電聚焦（按pI分離） 和SDS-PAGE（第二維，按分子量分離）。

（2）能將復(fù)雜的蛋白質(zhì)混合物（如全細(xì)胞裂解液）分離成數(shù)千個點，是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的強(qiáng)大工具。

四、主要應(yīng)用

分子量測定

樣品純度分析

蛋白質(zhì)表達(dá)水平比較

免疫印跡分析

蛋白質(zhì)組學(xué)研究

酶活性分析（非變性電泳）

五、總結(jié)

蛋白質(zhì)電泳，尤其是SDS-PAGE，通過結(jié)合電場驅(qū)動和凝膠分子篩效應(yīng)，并利用SDS處理標(biāo)準(zhǔn)化蛋白質(zhì)的電荷/質(zhì)量比，成功地將復(fù)雜的蛋白質(zhì)混合物按照分子量大小進(jìn)行高效分離，成為現(xiàn)代生物化學(xué)和分子生物學(xué)實驗室基礎(chǔ)分析技術(shù)。